La pédagogie des Maisons familiales rurales est basée sur l’alternance de semaines de cours à la MFR, où sont dispensés des cours et des activités théoriques et pratiques, et des semaines en entreprise, en situation professionnelle

La MFR s’appuie sur une pédagogie de l’alternance visant à équilibrer les séquences vécues en milieu socioprofessionnel et celles de formation dans l’établissement. Cette pédagogie particulière permet d’exploiter et d’enrichir les expériences de terrain mais surtout d’affirmer les motivations du jeune.